Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD1Q99460 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms