Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK5RAP2Q96SN8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP2Q96SN8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms