Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS6KC1Q96S38 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS6KC1Q96S38 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms