Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CICQ96RK0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CICQ96RK0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms