Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms