Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SAMD11Q96NU1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAMD11Q96NU1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms