Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW7

TIGD1, Tigger transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD1Q96MW7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TIGD1Q96MW7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIGD1Q96MW7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms