Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIPOR3Q96MK2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms