Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CFAP53Q96M91 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFAP53Q96M91 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms