Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SUSD3Q96L08 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SUSD3Q96L08 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms