Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM71F1Q96KD3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM71F1Q96KD3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms