Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CELF6Q96J87 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF6Q96J87 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF6Q96J87 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF6Q96J87 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF6Q96J87 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF6Q96J87 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF6Q96J87 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF6Q96J87 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF6Q96J87 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF6Q96J87 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CELF6Q96J87 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF6Q96J87 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF6Q96J87 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF6Q96J87 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF6Q96J87 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CELF6Q96J87 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms