Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD1Q96GM5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD1Q96GM5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms