Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCMH1Q96GD3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCMH1Q96GD3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms