Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRRFQ96E11 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRRFQ96E11 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms