Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTP4Q96DX8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTP4Q96DX8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms