Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC5Q96DU9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC5Q96DU9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms