Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF653Q96CK0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF653Q96CK0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms