Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NSUN4Q96CB9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSUN4Q96CB9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms