Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF428Q96B54 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF428Q96B54 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms