Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN23Q96B33 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms