Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HPS3Q969F9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS3Q969F9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms