Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CLP1Q92989 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLP1Q92989 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms