Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DNAAF4Q8WXU2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms