Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf54Q8WWF1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf54Q8WWF1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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