Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PATJQ8NI35 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms