Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTLL11Q8NHH1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTLL11Q8NHH1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTLL11Q8NHH1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms