Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PJA1Q8NG27 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PJA1Q8NG27 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PJA1Q8NG27 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PJA1Q8NG27 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PJA1Q8NG27 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PJA1Q8NG27 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PJA1Q8NG27 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PJA1Q8NG27 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PJA1Q8NG27 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PJA1Q8NG27 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms