Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA6DQ8NFY4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA6DQ8NFY4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms