Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCPH1Q8NEM0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms