Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CARMIL3Q8ND23 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL3Q8ND23 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms