Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PNPLA1Q8N8W4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms