Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6T3

ARFGAP1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP1Q8N6T3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGAP1Q8N6T3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGAP1Q8N6T3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms