Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GCSAMQ8N6F7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCSAMQ8N6F7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms