Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZCCHC9Q8N567 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZCCHC9Q8N567 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms