Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CA13Q8N1Q1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CA13Q8N1Q1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms