Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOT2Q8IXI1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOT2Q8IXI1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOT2Q8IXI1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms