Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPAINQ86UA6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.1 ms