Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCGF5Q86SE9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCGF5Q86SE9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCGF5Q86SE9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms