Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPP1R42Q7Z4L9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R42Q7Z4L9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms