Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE3BQ7Z3V4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE3BQ7Z3V4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms