Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SV2AQ7L0J3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SV2AQ7L0J3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms