Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
FGD6Q6ZV73 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
FGD6Q6ZV73 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
FGD6Q6ZV73 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
FGD6Q6ZV73 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FGD6Q6ZV73 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms