Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VITQ6UXI7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms