Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
APOA5Q6Q788 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
APOA5Q6Q788 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms