Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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LCN8Q6JVE9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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LCN8Q6JVE9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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LCN8Q6JVE9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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LCN8Q6JVE9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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LCN8Q6JVE9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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LCN8Q6JVE9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCN8Q6JVE9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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LCN8Q6JVE9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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LCN8Q6JVE9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
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LCN8Q6JVE9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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LCN8Q6JVE9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCN8Q6JVE9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCN8Q6JVE9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LCN8Q6JVE9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCN8Q6JVE9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCN8Q6JVE9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCN8Q6JVE9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCN8Q6JVE9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCN8Q6JVE9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LCN8Q6JVE9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCN8Q6JVE9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCN8Q6JVE9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCN8Q6JVE9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LCN8Q6JVE9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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