Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCSD1Q6JBY9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCSD1Q6JBY9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCSD1Q6JBY9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms