Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CACHD1Q5VU97 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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