Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
MYOM3Q5VTT5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
MYOM3Q5VTT5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MYOM3Q5VTT5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms