Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LGSNQ5TDP6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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